Cursus Basis in de Bio-Informatica
Startdatum is nog niet bepaald
Wil je de basisbegrippen leren die binnen bio-informatica gebruikt worden? Een beeld krijgen van welke soorten onderzoek er gedaan kunnen worden met bio-informatica? Weten hoe je online beschikbare software kan gebruiken voor een eerste analyse? Dan is deze cursus iets voor jou!
In het kort
LET OP: Deze cursus is in ontwikkeling en daarom ontbreken nog enkele details. Wil je meer weten of alvast je interesse kenbaar maken? Mail dan naar cursus.atbc@han.nl.
Waarom de cursus Basis in de Bio-informatica
Bij deze introductie in de bio-informatica neem je een kijkje in de keuken van de bio-informaticus. Ook ga je zelf hands-on aan de slag om biologische vragen te beantwoorden met de rekenkracht van computers. Je gaat bijvoorbeeld aan de slag met hoe je online bronnen en tools kan gebruiken om een biologische vraag te beantwoorden. De theorie wordt gecombineerd met gebruik van gratis beschikbare software.
Na afronding kan/begrijp je:
- De basisprincipes van de vertaling van biologie naar databases en terug;
- De basisprincipes van het toepassen van informatica om biologische vragen te beantwoorden;
- Enkele bio-informatica databases en tools vinden en gebruiken om een eerste analyse mee uit te voeren.
Mocht je al ervaring hebben met programmeren óf met moleculaire biologie of genetica dan is deze training uitermate geschikt wanneer je een eerste stap wil zetten in bioinformatica met Python.
Voor wie is de cursus Basis in de Bio-informatica
Deze cursus is geschikt voor een breed publiek.
Denk hierbij aan analisten, biotechnologen, biobased productontwikkelaars, celbiologen, (basis-)artsen, (klinisch-)genetici, veredelaars en fytopathologen.
Uiteraard is de cursus geschikt voor een ieder die geïnteresseerd is in een kennismaking met bio-informatica.
Voorkennis in de biologie/life sciences is gewenst.
Programma van de cursus Basis in de Bio-informatica
Dag 1: Basis in concepten binnen biologie en informatica die relevant zijn voor Bioinformatica
- Hoe vertalen we de biologie van een cel naar data punten en hoe ziet die data er dan uit
- Hoe haal je die data of relevante informatie uit online databases voor data opslag en hoe gebruik je digitale tools om hier iets mee te doen (NCBI, SRA, EMBL-EBI)
Dag 2: Basis in programmeren voor bioinformatici (Bash/Python/R)
- Waarom kies je voor een specifieke programmeertaal
- Markdown tools om programmeren en verslaglegging te combineren
- Lineaire programmeer concepten zoals variabelen, data-structuren, loops, conditional statements en functies
- Wat is een pipeline en hoe werkt het aan elkaar schakelen van programma’s
Dag 3: Basis in sequentie analyse van DNA, RNA en eiwit en diverse alignment tools (needle, Clustal Omega, MUSCLE, MAFFT)
- Wat vertellen Multiple Sequence Alignments ons over sequenties
- Hoe koppelen we wat we al weten aan wat we bekijken
Dag 4: Basis in genomics, transcriptomics en algehele data visualisatie
- Hoe zoeken we naar de oorzaak van een genetische ziekte, zoals kanker
- Hoe bekijken we wat de mogelijke invloed van verschillende condities is op de expressie van genen
- Hoe bekijken we genetische informatie
Verdere informatie
Ontvang persoonlijk advies over Basis in de Bio-Informatica
Wil je de cursus Basis in de Bio-Informatica volgen? Heb je nog vragen, voordat je definitief besluit? Neem dan gerust contact met ons op. Ook kunnen we een adviesgesprek plannen. Tijdens een adviesgesprek kun je je verwachtingen toetsen en bespreken of de cursus aansluit bij jouw ambities. Het adviesgesprek vindt plaats op een moment dat het jou uitkomt. Bij de HAN, telefonisch of via Teams. Neem via onderstaande links contact op met onze adviseurs of mail ons op cursus.atbc@han.nl.
Bekijk ook eens deze cursus
Nieuwsgierig naar andere cursussen?
Met de HAN geef je jouw carrière een positieve impuls en kun je verder groeien in jouw vakgebied. Bekijk het uitgebreide aanbod op het gebied van Life Sciences & Chemie, variërend van een enkele studiedag of meerdaagse (post hbo-)cursussen.
